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科学家呼吁:第一时间共享新型冠状病毒基因组序列


本文摘要:来点科学/中青报·中青在线记者今天从中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心得知,1月26日,国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心收录于由中国医学科学院病原生物学研究所获取的5株2019新型冠状病毒仅有基因组序列。

来点科学/中青报·中青在线记者今天从中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心得知,1月26日,国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心收录于由中国医学科学院病原生物学研究所获取的5株2019新型冠状病毒仅有基因组序列。这是自2019年12月该病愈演愈烈以来,国内公共数据平台首次公开发表公布数据。据国家基因组科学数据中心主任鲍一明讲解,从2020年1月以来,相继有30余株2019新型冠状病毒的基因组序列被国内外科学家破解,绝大部分数据都提交到由德国创建的全球流感序列数据库(GISAID)系统。

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从该数据库系统获取数据必须登记账号并经过审查,取得权限的研究人员才可指定系统网页数据,并且不能单个iTunes基因组序列。这就造成了中国产生的数据必须再行出口再行入口的用于模式和现象,而且数据iTunes十分繁复费时。2020年1月22日,我国搭起的新型冠状病毒信息库(https://bigd.big.ac.cn/ncov)月上线。

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国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心仍然致力于建构国家级组学数据存储与分享公共平台,力争第一时间为国内乃至全球科学家获取基因组数据的遗管用服务。此次疫情愈演愈烈后,新型冠状病毒信息库上线,维持该病毒基因组数据公布动态,持续为国内外科研人员获取方便快捷的数据检索及iTunes资源。

此次公布的5株2019新型冠状病毒基因组序列的序列号为GWHABKF00000000、GWHABKG00000000、GWHABKH00000000、GWHABKI00000000、GWHABKJ00000000,网卓新闻网,涉及项目编号为PRJCA002165。以上序列可在国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心的项目库或者冠状病毒序列库检索并iTunes,需要登记或向数据提交者申请人。鲍一明告诉他中青报·中青网记者,“我们敦促全国的科研卫生机构在第一时间把2019新型冠状病毒基因组序列提交到国家生物信息中心/国家基因组科学数据中心存储分享,为该病毒的科研和防控提供数据承托。

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